Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHW4

4933430I17Rik, RIKEN cDNA 4933430I17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933430I17RikQ8BHW4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933430I17RikQ8BHW4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933430I17RikQ8BHW4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms