Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4bQ8BGE6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Atg4bQ8BGE6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Atg4bQ8BGE6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Atg4bQ8BGE6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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Atg4bQ8BGE6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4bQ8BGE6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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