Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Htatsf1Q8BGC0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htatsf1Q8BGC0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms