Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA5

Krr1, KRR1 small subunit processome component homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krr1Q8BGA5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krr1Q8BGA5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms