Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Katnb1Q8BG40 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Katnb1Q8BG40 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms