Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFV3

Dusp4, Dual specificity protein phosphatase 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp4Q8BFV3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Dusp4Q8BFV3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Dusp4Q8BFV3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms