Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpped1Q8BFS6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cpped1Q8BFS6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpped1Q8BFS6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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