Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChfrQ810L3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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ChfrQ810L3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChfrQ810L3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms