Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Amigo1Q80ZD8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms