Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp8Q80YR6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbbp8Q80YR6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms