Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kdm5bQ80Y84 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm5bQ80Y84 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5bQ80Y84 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms