Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrfn4Q80XU8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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