Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg2bQ80XK6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms