Protein–RNA interactions for Protein: Q80XG9

Lrrtm4, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 4, mousemouse

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Length 590 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm4Q80XG9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm4Q80XG9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrtm4Q80XG9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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