Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ell3Q80VR2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms