Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2q1Q7TSS2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms