Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LnpkQ7TQ95 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LnpkQ7TQ95 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LnpkQ7TQ95 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LnpkQ7TQ95 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LnpkQ7TQ95 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LnpkQ7TQ95 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LnpkQ7TQ95 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LnpkQ7TQ95 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LnpkQ7TQ95 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LnpkQ7TQ95 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LnpkQ7TQ95 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LnpkQ7TQ95 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LnpkQ7TQ95 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LnpkQ7TQ95 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LnpkQ7TQ95 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LnpkQ7TQ95 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LnpkQ7TQ95 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LnpkQ7TQ95 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LnpkQ7TQ95 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LnpkQ7TQ95 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LnpkQ7TQ95 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LnpkQ7TQ95 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms