Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HhipQ7TN16 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HhipQ7TN16 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms