Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg4Q7TMD7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg4Q7TMD7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms