Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd4Q6ZPR5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd4Q6ZPR5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms