Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl3Q6W5C0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms