Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnip1Q6QD59 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms