Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med16Q6PGF3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms