Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf4Q6PFF0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf4Q6PFF0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms