Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmeff1Q6PFE7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms