Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad54bQ6PFE3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad54bQ6PFE3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms