Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1cQ6PDZ2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms