Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms