Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T2

Snrnp200, U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp200Q6P4T2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms