Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Podnl1Q6P3Y9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms