Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2B1

Tnpo3, Transportin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo3Q6P2B1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo3Q6P2B1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms