Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rcbtb1Q6NXM2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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