Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SphkapQ6NSW3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SphkapQ6NSW3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms