Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tpm4Q6IRU2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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