Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg9bQ6EBV9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms