Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Swap70Q6A028 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Swap70Q6A028 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Swap70Q6A028 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Swap70Q6A028 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Swap70Q6A028 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Swap70Q6A028 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Swap70Q6A028 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Swap70Q6A028 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Swap70Q6A028 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Swap70Q6A028 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Swap70Q6A028 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Swap70Q6A028 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Swap70Q6A028 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Swap70Q6A028 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Swap70Q6A028 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Swap70Q6A028 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Swap70Q6A028 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Swap70Q6A028 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Swap70Q6A028 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Swap70Q6A028 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Swap70Q6A028 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Swap70Q6A028 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Swap70Q6A028 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Swap70Q6A028 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Swap70Q6A028 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms