Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zcchc2Q69ZB8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc2Q69ZB8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms