Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fnip1Q68FD7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fnip1Q68FD7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms