Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp9cQ66X01 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms