Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q66JV7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q66JV7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q66JV7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q66JV7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q66JV7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q66JV7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q66JV7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q66JV7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q66JV7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q66JV7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q66JV7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q66JV7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q66JV7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q66JV7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q66JV7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q66JV7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q66JV7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q66JV7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q66JV7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q66JV7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q66JV7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q66JV7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q66JV7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q66JV7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q66JV7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q66JV7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q66JV7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q66JV7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q66JV7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q66JV7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q66JV7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q66JV7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q66JV7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q66JV7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q66JV7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q66JV7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q66JV7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q66JV7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q66JV7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q66JV7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q66JV7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q66JV7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q66JV7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q66JV7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q66JV7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q66JV7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q66JV7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q66JV7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q66JV7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q66JV7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q66JV7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q66JV7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q66JV7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q66JV7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q66JV7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q66JV7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q66JV7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q66JV7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q66JV7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q66JV7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q66JV7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q66JV7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q66JV7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q66JV7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q66JV7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q66JV7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q66JV7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q66JV7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q66JV7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q66JV7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q66JV7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q66JV7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms