Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna3Q65CL1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms