Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc3Q64519 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms