Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

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Length 666 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Abcg1Q64343 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Abcg1Q64343 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Abcg1Q64343 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Abcg1Q64343 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcg1Q64343 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms