Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tbr1Q64336 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tbr1Q64336 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tbr1Q64336 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tbr1Q64336 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbr1Q64336 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Tbr1Q64336 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tbr1Q64336 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tbr1Q64336 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbr1Q64336 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbr1Q64336 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbr1Q64336 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbr1Q64336 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbr1Q64336 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tbr1Q64336 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tbr1Q64336 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tbr1Q64336 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tbr1Q64336 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tbr1Q64336 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tbr1Q64336 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbr1Q64336 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tbr1Q64336 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tbr1Q64336 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbr1Q64336 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tbr1Q64336 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbr1Q64336 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbr1Q64336 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbr1Q64336 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbr1Q64336 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbr1Q64336 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbr1Q64336 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbr1Q64336 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbr1Q64336 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbr1Q64336 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tbr1Q64336 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tbr1Q64336 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Tbr1Q64336 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tbr1Q64336 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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