Protein–RNA interactions for Protein: Q640P7

Tbccd1, TBCC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbccd1Q640P7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbccd1Q640P7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms