Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccdc18Q640L5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc18Q640L5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
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