Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga3Q62470 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms