Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vil1Q62468 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vil1Q62468 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vil1Q62468 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vil1Q62468 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vil1Q62468 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vil1Q62468 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vil1Q62468 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vil1Q62468 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vil1Q62468 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vil1Q62468 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vil1Q62468 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vil1Q62468 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vil1Q62468 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vil1Q62468 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vil1Q62468 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vil1Q62468 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vil1Q62468 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms