Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vat1Q62465 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms