Protein–RNA interactions for Protein: Q62457

Gm20917, (clone BALB8N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20917Q62457 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20917Q62457 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms